Қазақстан Республикасы қабылдаған ЕЭО мемлекеттер-мүшелерінің алдындағы міндеттеме мен тауарларды қадағалау есепке алу жүйесін құру бойынша ДСҰ негізінде ЭШФ АЖ-не электрондық шот-фактураларды жазуға ауыстыру көзделген және кезең-кезеңмен  көшу міндеттіне  байланысты:

- 2016 жылғы 1 қаңтардан бастап–уәкілетті экономикалық операторларға электрондық шот-фактуралардың көшірмелері міндетті түрде;

- 2016 жылғы 1 шілдеден бастап –кеден өкілдері, кедендік тасымалдаушылар, уақытша сақтау қоймаларының иелері, кеден қоймаларының иелеріне электрондық шот-фактуралардың көшірмелері міндетті түрде.

2017 жылы Салық кодексінің 263 бабына шот-фактураларды электронды жазуға міндетті түрде кезең-кезеңмен көшу бойынша өзгерту енгізілді, атап айтқанда:

- 2018 жылғы 1 қаңтарынан бастап– мониторингке жататын ірі салық төлеушілер;

- 2019 жылғы 1 қаңтарынан бастап–Қазақстан Республикасының Салық кодексінің 228 бабының 1 тармағының 1 тармақшасына сәйкес ҚҚС төлеушілер көзделген. Электрондық шот-фактура бойынша ЭШФ АЖ www.esf.gov.kz порталда шығарылады. ЭШФ жазып бастау үшін, қатысушының ЭШФ АЖ тіркеліп, жүйені пайдалану келісімін жасау қажет.

Шот-фактураларды электронды түрде шығару кезінде неғұрлым ыңғайлы және үнемді, өйткені ЭШФ келесідей артықшылықтары бар:

- ЭШФ жазып беру мерзімі 15 күнге ұзартылған  7 күнгі шот-фактуралар қағаз жеткізгіште   салыстырғанда мерзімін құрайды;

- шетел валютасын белгіленген жағдайларда ЭШФ жазып беру мүмкіндінгі;

- өз қызметкерлеріне өкілеттік бойынша шот-фактураларын жазып беру мүмкіндігі;

- ЭШФ құрылымдық бөлімшелеріне берілген және алынған көру мүмкіндігі;

- егер Сіз барлық шот-фактуралар электронды түрде шығарылған болса,  өткізілген тауарлар, жұмыстар, қызмет көрсетулер (300.07) бойынша тізбені ұсынбау мүмкіндігі;

- егер Сіз барлық шот-фактуралар электронды түрде шығарылған болса,   өткізілген тауарлар, жұмыстар, қызметтер (300.08)  бойынша тізбені ұсынбау мүмкіндігі;

- мөр дайындауға қаражат пен қағазды үнемдеу мүмкіндігі;

- ЭШФ алушыға орналасқан орнына қарамастан жедел жеткізу, сондай-ақ, ЭШФ АЖ-де сатып алушы мен жеткізуші арасында жылдам хабар алмасу үшін;

- ЭШФ АЖ форматтық-логикалық бақылау жүргізеді, себебі қателердің жоқтығы;

- ЭШФ АЖ "Қазынашылық-клиент" АЖ-нен шотты төлеуге автоматты түрде қалыптастыру, егер тауарларды алушы, жұмыстарды, мемлекеттік мекемесі көрсетілетін қызметтерді, электрондық қаржы құжаттарының төлеу қозғалысының ашықтығын қамтамасыз етеді.